circRNA研究最近有哪些新进展？ 文献精选丨-中洪博元医学实验帮
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circRNA（Circular RNAs，环形RNA分子）已经被验证为一种新的单链RNA，是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴，以共价键形成环形结构的非编码RNA分子,广泛在哺乳动物组织中表达，具有高度保守性。
1circRNA主要来源
circRNA主要来源于基因外显子（exon）, 5'和3'识别两端的GT / AG以共价键方式拼接成环状covalently back-spliced（Figue1A）。部分circRNA分子含miRNA应答元件(miRNAresponse element机甲露宝 ，MRE)，可充当竞争性内源RNA(competing endogenousRNA卷毛头，ceRNA)，与miRNA结合，在细胞中起到miRNA海绵（miRNA sponge）的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达水平，亦可以作为转录因子直接作用于RNA结合蛋白。
Figue 1. Global landscape of human cardiac circRNA
哺乳动物的心脏相关circRNA研究已经被报道，目前还没有全面的人类心脏疾病的circRNA的研究注释和深度分析以及其他类型的非心脏组织之间的对比研究。本篇文章A landscape of circular RNA expression in the human heart，完成了对心脏组织circRNA表达的基因图谱研究，对circRNA在心脏组织表达情况进行深度分析以及分析其在组织分化中的影响。
Table 1.Linear genes and transcript-lengths with the top highest number of circRNA isoforms expressed in human hearts
2测序
通过对人类心脏组织进行RNAseq测序，总计发现15318条circRNA，其中有6448条circRNA来源于high-confidence exonic circRNA。通过与数据库进行比对分析注释，发现82.32% (12?611/15?318) 的circRNA来源于外显子，而主要的exonic circRNA（外显子来源的circRNA）属于编码区外显子(96.42%, 12极点舞曲网?160/12?611)（Figue1B）。王百洋其中单个外显子来源的exoniccircRNA约占～8% (1005/12?611)，而～16% (2046/12?611)至少跨越10个外显子，最长的circRNA为circTTN-366笑傲官途，跨越153个外显子。表达最高的circRNA对应的关键心脏基因为：TTN, RYR2 and DMD。人类最长的转录本TTN基因单独表达了401种不同的circRNA亚型（Table1）.
33RT-PCR方法验证结果
为了证实RNAseq测序出来的表达在心脏的circRNA，作者选择了11个高、中、低表达的cardiac-expressed circRNA，用RT-PCR方法验证，结果如Figue2.
Figue 2.alidation of human cardiac circRNA candidates.
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